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国家临床重点专科, 江西省临床重点专科
2011年7月18日亚专科成立，初露锋芒的肝胆胰外科，如同破土初生的嫩苗，在赣南地区开始生根发芽。至2017年10月随着南院区的启用，肝胆胰外科在南院区正式独立成科，茁壮成长。如今科室已经发展成为具有6位高级职称，三位博士，四位在职博士，两位硕士研究生导师的专科化团队。学科带头人谢元财教授是江西省肝胆胰外科著名专家，是赣州市医学会外科学分会主任委员。
如今的肝胆胰外科已走上高质量的发展之路，医疗、教学、科研三足鼎立，临床研究型学科格局初现端倪。2021年9月和南方医科大学南方医院共建国家区域医疗中心以来科室技术水平、科研能力和影响力实现跨域式提升。肝脏外科、胆道外科、胰腺外科三大亚专科组相继成立，科室技术向更细的亚专科深入发展。科研不断创新，近5年科室先后获得2项江西省重点科研立项，3项省自然科学基金，2项赣州市重点科研立项。科室的规模和技术水平领跑赣南，惊艳全省，目前是国家重点临床专科建设单位、江西省临床重点建设专科、江西省省市共建学科、赣州市医学领先学科、医院“十大名科”。并被国家卫计委、人民网评为“全国群众满意科室”的殊荣。
肝胆胰外科在科室规模、人才技术均走在赣南的前列，已成为赣南地区肝胆胰复杂病症诊疗研究中心。机器人微创外科、单孔腹腔镜肝叶切除术、ERCP联合腹腔镜胰腺肿瘤剜除术、外伤性脾破裂保脾手术、严重胰腺外伤的胰腺假性囊肿化胰胃吻合术为科室创新技术；肝脏肿瘤的MDT诊疗与荧光腹腔镜精准肝切除术、肝胆管结石的多模态微创手术以及"双轴十字法"腹腔镜胰十二指肠切除术是科室的三大特色技术；即将开展的肝移植外科也将引领赣南肝胆胰外科的未来发展方向。
南院区：0797-5889858、蓉江院区：0797-8181725
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特色技术: 肝脏肿瘤以手术为主的个体化综合治疗
适应症: 肝细胞癌、肝内胆管细胞癌
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特色技术: 复杂肝胆管结石的序贯清石治疗
适应症: 全肝型肝内胆管结石
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特色技术: 胆胰疾病的内镜治疗
适应症: 胆总管结石、胆道狭窄、胆胰肿瘤
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特色技术: 胆胰肿瘤联合血管切除置换的根治性手术
适应症: 胆胰恶性肿瘤
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特色技术: 肝胆胰腹腔镜微创治疗
适应症: 各类肝胆胰疾病
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特色技术: 重症胰腺炎的阶梯式治疗
适应症: 重症胰腺炎
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特色技术: 日间手术
适应症: 胆囊结石、胆囊息肉等